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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
26/09/2017 |
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Data da última atualização: |
26/09/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PERSEGUINI, J. M. K. C.; OBLESSUC, P. R.; ROSA, J. R. B. F.; GOMES, K. A.; CHIORATO, A. F.; CARBONELL, S. A. M.; GARCIA, A. A. F.; VIANELLO, R. P.; BENCHIMOL-REIS, L. L. |
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Afiliação: |
JULIANA MORINI KÜPPER CARDOSO, IAC; PAULA RODRIGUES OBLESSUC, LABORATÓRIO NACIONAL DE BIOCIÊNCIAS, Campinas-SP; JOÃO RICARDO BACHEGA FEIJÓ ROSA, ESALQ; KLEBER ALVES GOMES, IAC; ALISSON FERNANDO CHIORATO, IAC; SERGIO AUGUSTO MORAIS CARBONELL, IAC; ANTONIO AUGUSTO FRANCO GARCIA, ESALQ; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; LUCIANA LASRY BENCHIMOL-REIS, IAC. |
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Título: |
Genome-wide association studies of anthracnose and angular leaf spot resistance in common bean (Phaseolus vulgaris L.). |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 11, n. 3, e0150506, Mar. 2016. |
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DOI: |
10.1371/journal.pone.0150506 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The common bean (Phaseolus vulgaris L.) is the world?s most important legume for human consumption. Anthracnose (ANT; Colletotrichum lindemuthianum) and angular leaf spot (ALS; Pseudocercospora griseola) are complex diseases that cause major yield losses in common bean. Depending on the cultivar and environmental conditions, anthracnose and angular leaf spot infections can reduce crop yield drastically. This study aimed to estimate linkage disequilibrium levels and identify quantitative resistance loci (QRL) controlling resistance to both ANT and ALS diseases of 180 accessions of common bean using genomewide association analysis. A randomized complete block design with four replicates was performed for the ANT and ALS experiments, with four plants per genotype in each replicate. Association mapping analyses were performed for ANT and ALS using a mixed linear model approach implemented in TASSEL. A total of 17 and 11 significant statistically associations involving SSRs were detected for ANT and ALS resistance loci, respectively. Using SNPs, 21 and 17 significant statistically associations were obtained for ANT and angular ALS, respectively, providing more associations with this marker. The SSR-IAC167 and PvM95 markers, both located on chromosome Pv03, and the SNP scaffold00021_89379, were associated with both diseases. The other markers were distributed across the entire common bean genome, with chromosomes Pv03 and Pv08 showing the greatest number of loci associated with ANT resistance. The chromosome Pv04 was the most saturated one, with six markers associated with ALS resistance. The telomeric region of this chromosome showed four markers located between approximately 2.5 Mb and 4.4 Mb. Our results demonstrate the great potential of genome-wide association studies to identify QRLs related to ANT and ALS in common bean. The results indicate a quantitative and complex inheritance pattern for both diseases in common bean. Our findings will contribute to more effective screening of elite germplasm to find resistance alleles for marker-assisted selection in breeding programs. MenosThe common bean (Phaseolus vulgaris L.) is the world?s most important legume for human consumption. Anthracnose (ANT; Colletotrichum lindemuthianum) and angular leaf spot (ALS; Pseudocercospora griseola) are complex diseases that cause major yield losses in common bean. Depending on the cultivar and environmental conditions, anthracnose and angular leaf spot infections can reduce crop yield drastically. This study aimed to estimate linkage disequilibrium levels and identify quantitative resistance loci (QRL) controlling resistance to both ANT and ALS diseases of 180 accessions of common bean using genomewide association analysis. A randomized complete block design with four replicates was performed for the ANT and ALS experiments, with four plants per genotype in each replicate. Association mapping analyses were performed for ANT and ALS using a mixed linear model approach implemented in TASSEL. A total of 17 and 11 significant statistically associations involving SSRs were detected for ANT and ALS resistance loci, respectively. Using SNPs, 21 and 17 significant statistically associations were obtained for ANT and angular ALS, respectively, providing more associations with this marker. The SSR-IAC167 and PvM95 markers, both located on chromosome Pv03, and the SNP scaffold00021_89379, were associated with both diseases. The other markers were distributed across the entire common bean genome, with chromosomes Pv03 and Pv08 showing the greatest number of loci associated with AN... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Antracnose; Colletotrichum lindemuthianum; Feijão; Genoma; Mancha foliar; Phaseolus vulgaris. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/164342/1/CNPAF-2016-plosone.pdf
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Marc: |
LEADER 03030naa a2200301 a 4500
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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| Registros recuperados : 17 | |
| 2. |  | CHRISÓSTOMO, I. G.; LANNA, A. C.; GODOY, S. G.; ROSA, J. R.; DIDONET, A. D. N total e C orgânico do solo em transição para produção orgânica de arroz de terras altas (Oryza sativa L.) no cerrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CADEIA PRODUTIVA DE ARROZ, 2.; REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE ARROZ, 8., 2006, Brasília, DF. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2006. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 196).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 4. | | ROSA, J. R.; SOUZA, S. P.; FERREIRA, E. P. B.; DIDONET, A. D. Determinação de atividades enzimáticas do solo sob transição para cultivo orgânico de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: resumos. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. Resumo 55.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 5. | | CHRISÓSTOMO, I. G.; LANNA, A. C.; GODOY, S. G.; ROSA, J. R.; FERRARESI, T. M.; DIDONET, A. D. Propriedades bioquímicas do solo em transição para cultivo orgânico de arroz de terras altas (Oryza sativa L.) em sistema plantio direto e convencional. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CADEIA PRODUTIVA DE ARROZ, 2.; REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE ARROZ, 8., 2006, Brasília, DF. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2006. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 196).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 6. | | ROSA, J. R. B. F.; GUIMARÃES, C. T.; MAGALHAES, J. V. de; DIAS, K. O. das G.; SILVA, L. da C. e; PASTINA, M. M. Aplicação da associação genômica no melhoramento de plantas. In: PEIXOTO, L. de A.; BHERING, L. L.; CRUZ, C. D. (ed.). Seleção genômica aplicada ao melhoramento genético. Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2022. p. 47-71.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 7. | | GODOY, S. G. de; LANNA, A. C.; ROSA, J. R.; RAMOS, M. L. G.; MOREIRA, J. A. A.; DIDONET, A. D. Carbono da biomassa microbiana e carbono orgânico total no solo sob cultivo orgânico de arroz de terras altas na região de cerrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CADEIA PRODUTIVA DE ARROZ, 2.; REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE ARROZ, 8., 2006, Brasília, DF. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2006. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 196).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 8. | | ROSA, J. R.; LANNA, A. C.; GODOY, S. G. de; RAMOS, M. L. G.; MOREIRA, J. A. A.; DIDONET, A. D. Nitrogênio da biomassa microbiana e nitrogênio total no solo sob cultivo orgânico de arroz de terras altas (Oryza sativa L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CADEIA PRODUTIVA DE ARROZ, 2.; REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE ARROZ, 8., 2006, Brasília, DF. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2006. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 196).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 9. | | ROSA, J. R. B. F.; SILVA, R. R.; PASTINA, M. M.; BARRETO, F. Z.; BALSALOBRE, T. W. A.; SOUZA, A. P.; CARNEIRO, M. S.; GARCIA, A. A. F. Estimation of linkage disequilibrium on a Brazilian collection of sugarcane (Saccharum spp.) genotypes from AFLP, SSR and EST-SSR data. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 59., 2013, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2013. p. 54.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 10. | | CHRISÓSTOMO, I. G.; LANNA, A. C.; GODOY, S. G. de; ROSA, J. R.; RAMOS, M. L. G.; HEINEMANN, A. B.; MOREIRA, J. A. A.; DIDONET, A. D. Propriedades bioquímicas do solo sob cultivo orgânico do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.) em sistema plantio direto e convencional. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 8., 2005, Goiânia. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2005. v. 2. p. 1066-1069. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 182).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 12. | | ROSA, J. R.; LANNA, A. C.; FERRAZ, D. M. M.; GODOY, S. G. de; RABELO, V. C.; MOURÃO, V. C.; PALMA, F. R.; GUARDIOLA, M. F.; RAMOS, M. L. G.; HEINEMANN, A. B.; MOREIRA, J. A. A.; DIDONET, A. D. Nitrogênio da biomassa microbiana em solo sob cultivo orgânico de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 8., 2005, Goiânia. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2005. v. 2. p. 1030-1033. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 182).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 13. | | PERSEGUINI, J. M. K. C.; OBLESSUC, P. R.; ROSA, J. R. B. F.; GOMES, K. A.; CHIORATO, A. F.; CARBONELL, S. A. M.; GARCIA, A. A. F.; VIANELLO, R. P.; BENCHIMOL-REIS, L. L. Genome-wide association studies of anthracnose and angular leaf spot resistance in common bean (Phaseolus vulgaris L.). Plos One, v. 11, n. 3, e0150506, Mar. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 14. | | BARRETO, F. Z.; ROSA, J. R. B. F.; BALSALOBRE, T. W. A.; PASTINA, M. M.; SILVA, R. R.; HOFFMANN, H. P.; SOUZA, A. P. de; GARCIA, A. A. F.; CARNEIRO, M. S. A genome-wide association study identified loci for yield component traits in sugarcane (Saccharum spp.). Plos ONE, v. 14, n. 7, e0219843, July 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 15. | | GODOY, S. G. de; LANNA, A. C.; FERRAZ, D. M. M.; ROSA, J. R.; RABELO, V. C.; MOURÃO, V. C.; PALMA, F. R.; GUARDIOLA, M. F.; RAMOS, M. L. G.; HEINEMANN, A. B. MOREIRA, J. A. A.; DIDONET, A. D. Quantidade e atividade da biomassa microbiana no solo sob cultivo orgânico do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 8., 2005, Goiânia. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2005. v. 2. p. 1070-1073. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 182).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 16. | | MAGALHAES, J. V. de; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; MENEZES, C. B. de; ROSA, J. R. B. F.; GUIMARAES, C. T.; TARDIN, F. D.; SCHAFFERT, R. E.; GOMIDE, R. L.; ANDRADE, C. de L. T. de; ALBUQUERQUE, P. E. P. de; BASTOS, E. A.; CARDOSO, M. J. Escaneamento genômico para tolerância à seca em sorgo. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2016. 22 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 152).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 17. | | SOUZA, L. M. de; SANTOS, L. H. B. dos; ROSA, J. R. B. F.; SILVA, C. C. da; MANTELLO, C. C.; CONSON, A. R. O.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; FIALHO, J. de F.; MORAES, M. L. T. de; GONÇALVES, P. de S.; MARGARIDO, G. R. A.; GARCIA, A. A. F.; LE GUEN, V.; SOUZA, A. P. de. Linkage disequilibrium and population structure in wild and cultivated populations of rubber tree (Hevea brasiliensis). Frontiers in Plant Science, v. 9, article 815, 03 July 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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